はい。通勤交通費は非課税扱いとなります。

（参考）通勤交通費の増減の影響 

・所得税 　→非課税対象

・社会保険 　→「年収」に含むため、等級変更やご家族の扶養内枠に影響します。

・雇用保険 　→「賃金」に含むため、雇用保険料に影響します。